Meta‑analyse van NAD(P)(H)-kwantificeringsresultaten vertoont variabiliteit tussen zoogdierweefsels Ⅱ

Jun 01, 2023

Het effect van premortale versus postmortale weefselverzameling op NAD(P)(H)-niveaus.

We voorspelden dat er een waarneembaar verschil zou kunnen zijn in de NAD(P)(H)-redoxtoestand dat afhankelijk is van weefseloogstprocedures. Om deze vraag te beantwoorden, onderzochten we het effect van pre- versus postmortale procedures voor het verzamelen van weefsels op de NAD(P)(H)-redoxstatus. Voor deze analyse hebben we de waarden van leverweefsels van ratten vergeleken, gezien het grotere aantal onderzoeken dat hun opofferingsprotocol definieert. Bij onthulling verklaarden alle beoordeelde onderzoeken dat de weefselmonsters koud werden gehouden en onmiddellijk op ijs werden geëxtraheerd of ingevroren bij -80 graden voorafgaand aan NAD (P) (H) -metingen. Deze analyse stelde vast dat er geen significant verschil was in NAD plus concentraties in rattenlever (Fig. 6a) tussen weefsels die voor of na euthanasie waren geëxtraheerd. De gerapporteerde NADH-niveaus in rattenlever zijn echter significant hoger in post-mortemmonsters (Fig. 6b). Er werden geen verschillen in totale NAD(H)-niveaus (Fig. 6c) waargenomen, maar de NAD plus/NADH-ratio was lager in weefsels die werden verzameld na euthanasie (Fig. 6d), wat consistent is met de waargenomen variatie in NADH-niveaus. NADP plus, NADPH en de resultaten van de NADP plus /NADPH-ratio in rattenlever gegroepeerd op tijdstip van weefseloogst worden getoond in aanvullende figuur 9; het onvoldoende aantal post-mortemmonsters stelt ons echter niet in staat om het effect van het tijdstip van weefseloogst op NADP(H)-niveaus te interpreteren. In muizenlever was er geen verschil tussen pre- en post-mortem NAD plus niveaus, maar het aantal rapportagestudies was beperkt (Fig. 6e). NeeNADH,NADP plus, ofNADPHpostmortale gegevens binnenmuis leverter vergelijking beschikbaar was.

Flavonoid (2)

Klik hier om Hebrs Cistanche te krijgen


Discussie

Veel recente onderzoeken hebben aangetoond dat NAD(P)(H)-regulatie essentieel is voor cellulaire homeostase en redoxstatus. Gegevens verkregen van knaagdieren hebben geleid tot onderzoeken naar NAD plus-niveaus in menselijk bloed, als een minder invasieve indicator van NAD plus-niveaus in het hele lichaam. Recente klinische onderzoeken toonden aan dat NAD plus-niveaus werden verlaagd in ziektetoestanden23,47 en verhoogd na NAD plus boosting-strategieën23,44,48,49. We hebben een meta-analyse uitgevoerd van alle onderzoeken die tussen 1946 en 20 juni 2021 zijn gepubliceerd en die kwantitatieve gegevens bevatten voor NAD(P)(H)-niveaus bij zoogdiersoorten met een speciale focus op muizen, ratten en mensen, aangezien zij het meest vertegenwoordigen bestudeerde soorten op biomedisch gebied. Deze analyse werd gedeeltelijk uitgevoerd om het gemiddelde standaardniveau van NAD(P)(H)-concentraties in normale weefsels van zoogdieren te bepalen, gezien de welbekende variantie in deze metingen tussen studies. We hopen dat deze gegevens kunnen worden gebruikt om gestandaardiseerde protocollen op het gebied van NAD plus-onderzoek te stimuleren en om het gebruik van NAD(P)(H)-niveaus en redox-ratio's als betrouwbare biomarkers voor ziekte- en behandelingsregimes te bevorderen.

Ondanks de aanzienlijke variabiliteit in metingen in weefsels van knaagdieren, vertoonde deze meta-analyse vergelijkbare gemiddelde NAD plus-niveaus in weefsels, met enkele uitzonderingen. Interessant is dat de skeletspier van de muis lagere mediane NAD plus-niveaus vertoonde (Fig. 2a) dan andere sterk metabole weefsels (dwz lever, nier, hart en hersenen). Dit kan duiden op verschillende NAD(H)-redoxstatussen in skeletspieren of kan wijzen op grotere problemen met de extractie van metabolieten in fibreus weefsel. Deze waarnemingen konden echter niet worden geverifieerd bij mensen vanwege een gebrek aan bemonsterde weefsels buiten bloed en spieren.

Flavonoid-1

Er zijn veel potentiële factoren die de nauwkeurigheid van fysiologische NAD(P)(H)-metingen in weefselmonsters kunnen beïnvloeden. Bij rapportage beschreven alle studies weefsels als zijnde geoogst en direct ondergedompeld in vloeibare stikstof, of op ijs bewaard vóór bevriezing of verwerking om de warmtegevoelige fracties te behouden (NAD plus en NADP plus). Het effect van de pH op de verschillende NAD(P)(H)-fracties, zoals de zuur-labiele aard van de gereduceerde NAD(P)H-vormen, heeft door het merendeel van de onderzoeken geleid tot het gebruik van pH-neutrale extractiemiddelen . Gezien de snelle onderlinge omzetting van de gereduceerde en geoxideerde metabolieten en het effect van anoxie op NAD(H)50-53, is het echter ook belangrijk om te zorgen voor een snelle extractie van weefselmetabolieten en de juiste procedures voor het doven van cellulair NAD(P)(H). )-redox/consumptie-enzymen, zoals door middel van eiwitverwijdering. In deze zin geeft onze analyse van pre- versus postmortale weefselverzameling aan dat postmortemanalyse de vermindering van NAD plus bevordert. De vermindering van weefsel-NAD plus is eerder in vivo beschreven in de hersenen, het hart en de lever van ratten die werden blootgesteld aan een verlengde 2.{10}}h hypoxische atmosfeer54, een omgeving die gedeeltelijk kan worden gerecapituleerd door langere periodes van post- offer weefselverzameling op voor snel invriezen. Dit kan erop wijzen dat het extraheren van weefsels onder verdoving of het prioriteren van de onmiddellijke oogst van weefsels die bedoeld zijn om te worden gebruikt voor metabolietanalyse na opoffering, moet plaatsvinden om representatieve NAD(P)(H)-metingen te verkrijgen.

Er is ook het potentieel voor verschillende kwantificeringsmethoden, elk met verschillende beperkingen, om bij te dragen aan de algehele intra-onderzoeksvariabiliteit van NAD(P)(H)-metingen. In de afgelopen twee decennia waren de meest gebruikte methoden enzymcyclusassays, LC-MS en HPLC. Elk van deze methoden wordt beïnvloed door metabolietextractietechnieken, kwantificeringsparameters en de implementatie van de juiste kwaliteitscontroles. Met behulp van LC-MS, Lu et al. hebben aangetoond dat de interconversie tussen gereduceerde en geoxideerde vormen van NAD(P)(H)-metabolieten met verschillende snelheden plaatsvindt in verschillende extractiebuffers of oplosmiddelen met het acetonitril:methanol:water met 0.1 M mierenzuurmengsel dat de hoogste herstel met de minste onderlinge conversies31. Bij gebruik van LC-MS kan deze interconversie echter worden gecontroleerd tussen individuele monsters van een onderzoek door te verrijken met interne controles zoals NAD(P)(H)-isotopen, wat een voordeel is van de LC-MS-techniek ten opzichte van die van HPLC en enzym. fietstesten31,33,55. Desalniettemin kunnen verschillende factoren, zelfs met goed gecontroleerde LC-MS-technieken, het gemeten signaal verstoren, waaronder matrixeffecten en variaties in ionisatie-efficiëntie. Sommige onderzoeken gebruiken bijvoorbeeld 13C-gelabelde gistextracten als interne standaarden in op LC-MS gebaseerde metabolomics. Het verrijken van de geëxtraheerde monstermetabolietmatrix met een 13C-gelabelde metabolietmatrix uit gistextract kan echter verschillende gevolgen hebben, zoals ionenonderdrukking, waardoor het signaal van gelabelde en/of niet-gelabelde metabolieten wordt verminderd, en kan leiden tot fouten in de absolute kwantificering als dit niet het geval is. ontdekt door een grondige kwaliteitsbeoordeling56. Hoewel LC-MS-technieken in theorie de meting van meerdere NAD(P)(H)-metabolieten in één experiment mogelijk maken, zijn er nog steeds beperkingen aangezien optimale verdunningen moeten worden uitgevoerd als de metabolieten van belang grote verschillen in concentraties hebben. Dus ondanks hun voordelen ten opzichte van de eenvoudigere enzymcyclische assays, dwingt de complexiteit van LC-MS-methoden tot een grondige optimalisatie. Onlangs zijn nieuwe analytische methoden ontwikkeld, zoals NAD plus biosensoren en op beeldvorming gebaseerde massaspectrometrie, maar er zijn nog steeds onvoldoende kwantitatieve gegevens gegenereerd uit deze technieken om in een meta-analyse op te nemen. Hoewel één studie in onze meta-analyse een op papier gebaseerde bioluminescente biosensor gebruikte om NAD plus niveaus in muizenlever en andere monstertypes te meten. Deze studie werd opgenomen in de bioluminescente testgroep vanwege de vergelijkbare detectiemethode (Fig. 1a).


Flavonoid

Voor deze analyse zijn gegevens van 677 studies uitgesloten. Dit omvatte onderzoeken die relatieve NAD(P)(H)-resultaten opleverden (51 procent) in plaats van kwantitatieve, evenals onderzoeken waarin NAD(P)(H)-concentraatwas niet genormaliseerdweefsel gewicht, Eiwitgehalte, ofbloed volume(13 procent). 36 procent van de uitgesloten onderzoeken werd uitgevoerd op niet-geschikte specimens (bijv. niet-zoogdieren, cel- of weefselculturen). Naast de uitgesloten onderzoeken zijn de belangrijkste beperkingen in deze meta-analyse de variatie van, of het ontbreken van gerapporteerde informatie met betrekking tot, pre-analytische procedures (pre- of post-mortem extractie of extractiebufferinformatie) en/of de analytische methoden, samen met met de leeftijd, het geslacht, de genetische achtergrond, het dieet en de voedingsstatus bij het offeren voor knaagdieren.
Hoewel onze meta-analyse de variabiliteit tussen studies en de noodzaak om NAD(P)(H)-metingen te standaardiseren benadrukt, beoordeelt of debatteert onze analyse niet over devaliditeit van de vergelijkende resultatenbinnen een individueel onderzoek. Gezien de implicaties van meerdere NAD(P)(H)-metabolieten die dienen als biomarkers vangezondheid bij de mens, de standaardisatie of grondige studieoptimalisatie van pre-analytische enanalytische procedureszal toelatenbetere vergelijkingen van resultaten tussen studies. Dit wordt nog belangrijker met een toenameaantal klinische onderzoeken die het effect testen van geneesmiddelen of supplementen die worden gebruikt om NAD(P)(H)-niveaus in weefsels te veranderende gezondheid van de mens verbeteren.

Flavonoid (11)

methoden

Literatuuronderzoek. "Epub Ahead of Print", "In-Process & Other Non-Indexed Citations", "Versions", "PubMed-Not-MEDLINE", "Daily update", "Front segment wekelijkse update", "Back-bestanden uit 1946 om te beginnen van voorkantsegment" citaten tussen 1946 en 20 juni 2021, in de MEDLINE ALL (Ovid) database werden doorzocht enbeoordeeld voor artikelen met kwantitatieve gegevens van NAD(P)(H)-metabolietniveaus in weefsels van zoogdieren zoals uitgevoerd in bijlage S1. De zoekstrategie leverde 3377 artikelen op. Een aanvullende bloedgerichte zoektocht wasuitgevoerd met dezelfde database en leverde 1513 artikelen op (bijlage S2).
Screeningsmethode. Samenvattingen en titels die de kwantificering van NAD(P)(H)-metabolieten in weefsels en bloed van zoogdieren rapporteren, werden volledig gescreend. Alle abstracte beoordelingen zijn geverifieerd met een tweede beoordelingen eventuele conflicten werden opgelost. Na de abstracte screening werden 643 publicaties geselecteerd voor full-text reviewhet op weefsel gerichte zoeken en 272 voor het op bloed gerichte zoeken (aanvullende afbeelding 10). Studies die alleen preverzonden relatieve NAD(P)(H)-metabolietgegevens werden uitgesloten tijdens de full-text screening, met uitzondering vanstudies rapporteren NADplus/NADH-verhoudingen. Resultaten strikt afgeleid van weefsels, cellen, geïsoleerde organellen behoudenin media, of uit bloedeluens van perfusie werden uitgesloten. Deze full-text review leidde tot de uitsluiting van 667(457 plus 210) artikelen voornamelijk vanwege het ontbreken van NAD-metabolietgegevens (50,5 procent), gegevens afgeleid van niet-geschiktemonsters (36,3 procent), of gegevens gepresenteerd als relatieve/willekeurige eenheden (13,2 procent). Uiteindelijk zijn er 241 artikelen in opgenomende kwalitatieve meta-analyse en 205 in de kwantitatieve meta-analyse (aanvullende figuur 10). Hoewel onzede eerste zoekopdracht omvatte studies gepubliceerd van 1946 tot 20 juni 2021. Zoals hierboven vermeld, de oudste studie metkwantitatieve NAD(P)(H)-gegevens die voldeden aan onze acceptatiecriteria werden gepubliceerd in 1961


Data-extractie.

Numerieke gegevens voor NAD(P)(H)-metabolieten werden ofwel direct verkregen uit de artikelen of geëxtraheerd uit artikelcijfers met behulp van een semi-automatische data-extractiesoftware (WebPlotDigitizer58). Daarnaast werden, indien van toepassing, de tijdstippen voor weefselbemonstering met betrekking tot opoffering en/of methoden voor weefsel-/bloedmonstername (dwz methode van anesthesie en/of euthanasie, weefselhantering en opslagtemperatuur) geregistreerd. Voor diermodellen werden de soort, kenmerken (bijv. stam, genotype, leeftijd en gewicht) en omgevingsomstandigheden (bijv. slaapcyclus, type dieet, voedingsfrequentie en voedingstoestand ten opzichte van weefselmonsters) geregistreerd. Bovendien werden voor alle studies behandelingen (bijv. farmacologische behandelingen, operaties, bestraling, tumorinductie en andere procedures toegepast op de proefpersonen) en alle informatie over de studiegroep (bijv. behandelings- of ziektegroepen en overeenkomstige controles) geëxtraheerd. Ten slotte, de methode van NAD(P)(H)-kwantificeringsmethode (bijv. Enzymatische assays, op massaspectrometrie gebaseerd, HPLC, NMR, bioluminescentie) en publicatiespecificaties (dwz publicatietitel, referentiecode [DOI, Medline UI, PMID] of hyperlink en jaar van publicatie) werden genoteerd (aanvullend materiaal 2).



Gegevens analyse. Voorafgaand aan de analyse werden alle concentraties omgerekend naar nmol/g weefsel of nmol/g eiwitten voor weefselmonsters of nmol/ml voor bloedfracties. Vanwege het lage aantal resultaten genormaliseerd naar eiwitgehalte, tonen we alleen resultaten genormaliseerd naar weefselgewicht en bloedvolume. Statistische analyse werd uitgevoerd met GraphPad Prism versie 9.3.1 (GraphPad Sofware Inc., San Diego, Californië, VS,Beschikbaarheid van dataAlle gegevens die tijdens deze studie zijn geëxtraheerd en geanalyseerd, zijn opgenomen in dit gepubliceerde artikel en het aanvullende artikelinformatieflessen.Ontvangen: 29 april 2022; Geaccepteerd: 7 februari 2023



Referenties

1. Menzies, KJ, Zhang, H., Katsyuba, E. & Auwerx, J. Eiwitacetylering in metabolisme - metabolieten en cofactoren. Nat. Eerw. Endocrinol. 12, 43 (2016).
2. Chambon, P., Weill, JD, Doly, J., Strosser, MT & Mandel, P. Over de vorming van een nieuwe adenylverbinding door enzymatische extracten van leverkernen. Biochem. Biophys. Res. gemeenschappelijk. 25, 638-643 (1966).
3. Hassa, PO, Haenni, SS, Elser, M. & Hottiger, MO Nucleaire ADP-ribosylatiereacties in zoogdiercellen: waar staan ​​we vandaag en waar gaan we heen?. Microbiol. mol. Biol. R70, 789-829 (2006).
4. Takasawa, S., Nata, K., Yonekura, H. & Okamoto, H. Cyclische ADP-ribose bij insulinesecretie door bètacellen van de pancreas. Wetenschap 259, 370-373 (1993).
5. Wolf, IMA et al. Koplopers van T-celactivering: initiële, gelokaliseerde Ca2 plus-signalen gemedieerd door NAADP en de type 1 ryanodinereceptor. Wetenschap. Signaal. 8, ra102 (2015).
6. Malavasi, F. et al. Evolutie en functie van de ADP Ribosyl cyclase/CD38 genfamilie in fysiologie en pathologie. fysio. 88, 841-886 (2008).
7. Gasser, A., Bruhn, S. & Guse, AH Tweede boodschapperfunctie van nicotinezuuradeninedinucleotidefosfaat onthuld door een verbeterde enzymatische cyclustest*. J. Biol. Chem. 281, 16906-16913 (2006).
8. Kulkarni, CA & Brookes, PS Cellulaire compartimentering en de redox/niet-redoxfuncties van NAD plus. antioxidant. Redox-signaal.31, 623-642 (2019).
9. Xiao, W., Wang, R.-S., Handy, DE & Loscalzo, J. NAD(H) en NADP(H) redoxkoppels en cellulair energiemetabolisme. antioxidant. Redox-signaal. 28, 251-272 (2018).

10. Liefs, NR et al. NAD-kinase regelt de biosynthese van NADP bij dieren en wordt gemoduleerd via evolutionair uiteenlopende calmoduline-afhankelijke mechanismen. Proc. Natl. Acad. Wetenschap. 112, 1386-1391 (2015).


Vraag voor meer:

E-mail:wallence.suen@wecistanche.com whatsapp: plus 86 15292862950









Misschien vind je dit ook leuk