SARS-CoV-2 Infectie- en vaccineffectiviteit in Engeland (REACT-1): een reeks cross-sectionele willekeurige gemeenschapsenquêtes

Contactpersoon: Audrey Hu Whatsapp/hp: 0086 13880143964 E-mail:audrey.hu@wecistanche.com

Marc Chateau-Hyam, Haowei Wang*, Oliver Eales*, David Haw*, Barbara Bodinier*, Matthew Whitaker, Caroline E Walters, Kylie EC Ainslie, Christina Atchison, Claudio Fronterre, Peter J Diggle, Andrew J Page, Alexander J Trotter, Deborah Ashby, Wendy Barclay, Graham Taylor, Graham Cooke, Helen Ward, Ara Darzi, Steven Riley, Christl A Donnelly†, Paul Elliott†, in samenwerking met het COVID-19 Genomics UK-consortium

Overzicht

Achtergrond: Engeland heeft sinds eind mei 2{{40}}21 een derde golf van de COVID{{0}}-epidemie meegemaakt, die samenviel met de snelle verspreiding van de delta (B. 1.617.2) variant, ondanks hoge vaccinatiegraad bij volwassenen. De vaccinatiegraad (enkele dosis) in Engeland is lager bij kinderen van 16–17 jaar en 12–15 jaar, van wie de vaccinatie in Engeland respectievelijk in augustus en 2 september is begonnen021. We wilden de onderliggende dynamische rijpatronen in de prevalentie van SARS-CoV-2 op 2 september021 in Engeland analyseren. Methoden: de REal-time Assessment of Community Transmission-1 (REACT-1)-studie, die op 2 mei begon met het verzamelen van gegevens02{{10{{128} }}}, omvat een reeks willekeurige cross-sectionele onderzoeken onder de algemene bevolking van Engeland van 5 jaar en ouder. Met behulp van RT-PCR-swab-positiviteitsgegevens van {{20}} deelnemers met geldige keel- en neusswabs in ronde 14 van REACT-1 (9-27 september, 2021), we schatten de community-based prevalentie van SARS-CoV-2 en de effectiviteit van vaccins tegen infectie door gegevens van ronde 14 te combineren met gegevens van ronde 13 (24 juni tot 12 juli, 2021; n{{34} }). Bevindingen: op 2 september 021 schatten we een gemiddeld RT-PCR-positiviteitspercentage van 0·83 procent (95 procent CrI 0,76-0,89), met een reproductiegetal (R) totaal van 1,03 (95 procent CrI 0,94–1,14). Van de 475 (62,2 procent) van de 764 positieve uitstrijkjes waarvan de sequentie was bepaald, waren ze allemaal van de delta-variant; 22 (4,63 procent; 95 procent CI 3,07-6,91) omvatte de Tyr145His-mutatie in het spike-eiwit geassocieerd met de AY.4-sublijn, en er was één Glu484Lys-mutatie. Leeftijd, regio, status van de belangrijkste werknemer en grootte van het huishouden droegen samen bij aan het risico van swab-positiviteit. De hoogste gewogen prevalentie werd waargenomen bij kinderen van 5-12 jaar, met 2,32 procent (95 procent CrI 1,96-2,73) en kinderen van 13-17 jaar, met 2,55 procent (2,11-3 ·08). De SARS-CoV-2-epidemie groeide in de leeftijdsgroep van 5-11 jaar, met een R van 1,42 (95 procent CrI 1,18-1,68), maar nam af in de leeftijd van 18-54 jaar, met een R van 0,81 (0,68-0,97). Op de leeftijd van 18-64 jaar was de aangepaste vaccineffectiviteit tegen infectie 62,8 procent (95 procent BI 49,3-72,7) na twee doses vergeleken met niet-gevaccineerde mensen, voor alle vaccins samen 44,8 procent (22 ·5–60·7) voor het ChAdOx1 n Cov-19 (Oxford-AstraZeneca)-vaccin en 71,3 procent (56,6-81·0) voor het BNT162b2 (Pfizer-BioNTech)-vaccin. Bij personen van 18 jaar en ouder was de gewogen prevalentie van swab-positiviteit 0,35 procent (95 procent CrI 0,31–0,40) als de tweede dosis tot 3 maanden vóór hun uitstrijkje werd toegediend, maar 0,55 procent ( 0,50-0,61) voor degenen die hun tweede dosis 3-6 maanden voor hun uitstrijkje kregen, vergeleken met 1,76 procent (1,60-1,95) onder niet-gevaccineerde personen.Interpretatie:In september 2021, aan het begin van het herfstschooljaar in Engeland, namen de infecties exponentieel toe bij kinderen van 5-17 jaar, in een tijd dat de vaccinatiegraad laag was in deze leeftijdsgroep. Bij volwassenen, vergeleken met degenen die hun tweede dosis minder dan 3 maanden geleden kregen, suggereert de hogere prevalentie van swab-positiviteit 3-6 maanden na twee doses van het COVID-19-vaccin een verhoogd risico op doorbraakinfecties tijdens deze periode . Het vaccinatieprogramma moet zowel kinderen als niet-gevaccineerde en gedeeltelijk gevaccineerde volwassenen bereiken om de overdracht van SARS-CoV-2 en de daarmee samenhangende verstoringen van werk en onderwijs te verminderen. Financiering Ministerie van Volksgezondheid en Sociale Zorg, Engeland.

cistanche gezondheidsvoordelen: verbetering van de immuniteit

Invoering

Het VK heeft sinds het begin van de pandemie te maken gehad met een van de hoogste SARS-CoV-2-infecties en COVID-19-sterftecijfers in Europa. Het VK was echter ook een van de eerste landen die een nationaal vaccinatieprogramma implementeerde, te beginnen in december 2020, met uitrol naar de bevolking die aanvankelijk was gericht op degenen die het meeste risico liepen, inclusief ouderen (te beginnen met mensen ouder dan of gelijk aan 80 jaar). jaar), gezondheids- en sociale zorgverleners en mensen met specifieke gezondheidsproblemen

De snelle verspreiding van de delta (B.1.617.2) variant in Engeland vanaf mei 2021 viel samen met de derde golf van infecties2, en de prevalentie van infecties bleef hoog tot in de zomer en daarna. In augustus 2021 nam de incidentie van RT-PCR-bevestigde gevallen van SARS-CoV-2-infectie die zich voordeden aan het nationale testprogramma in Engeland (pijler 2) geleidelijk toe met meer dan 10 procent in totaal.

In september 2021 werd de uitrol van het nationale vaccinatieprogramma tegen COVID-19 in Engeland uitgebreid om een ​​booster (derde) dosis aan te bieden, ten minste 6 maanden na de tweede dosis, aan gezondheids- en maatschappelijk werkers, alle personen ouder dan 50 jaar en jongeren die risico lopen. Deze uitbreiding omvatte ook vaccinatie van oudere schoolgaande kinderen (in de leeftijd van 12 jaar of ouder), aan wie oorspronkelijk een enkele vaccindosis in het VK werd aangeboden. Medio september 2021 was het aantal mensen dat de eerste vaccinatiedosering kreeg echter gedaald tot het laagste niveau (gemiddeld iets minder dan 21000 doses per dag in het VK) sinds ten minste half januari 2021 (de vroegste gegevens die openbaar beschikbaar zijn) . Niettemin had op 26 september 2021 bijna 90 procent van de personen van 18 jaar en ouder in Engeland hun eerste dosis gekregen, had meer dan 83 procent hun tweede dosis gekregen en had 13 procent een derde vaccindosis gekregen. Van de kinderen van 12–17 jaar had 8,9 procent een enkele dosis gekregen. Ongeveer 53 procent van de volwassenen werd gevaccineerd met het ChAdOx1 nCov-19 (Oxford-AstraZeneca)-vaccin en 47 procent met het BNT162b2 (Pfizer-BioNTech) of het mRNA-1273 (Moderna)-vaccin;3 alle gevaccineerde kinderen in de leeftijd van 12-17 jaar kregen één dosis van het BNT162b2 (Pfizer-BioNTech) of mRNA-1273 (Moderna) vaccin.

Begin september 2021 keerden kinderen van 5-17 jaar in Engeland terug naar school, waarbij het ministerie van Onderwijs niet langer aanraadde dat het nodig was om inconsistente groepen voor kinderen te houden (ook wel sociale bubbels genoemd). Bovendien werd van scholen niet meer verwacht dat ze aan contactopsporing deden, waarbij nauwe contacten op scholen nu worden geïdentificeerd door het nationale programma voor contactopsporing (de Britse National Health Service [NHS] Test and Trace-service).4 Tijdens deze eerste maand van kinderen die terugkeerden naar school , daalde de incidentie van bevestigde SARS-CoV-2-gevallen in Engeland, geregistreerd via pijler 2, tot een dieptepunt medio september 2021 en steeg daarna weer, maar was over het algemeen relatief stabiel. Dit staat in schril contrast met de situatie in Schotland, waar de incidentie van bevestigde SARS-CoV-2-gevallen in augustus met meer dan 450 procent toenam, in een tijd waarin schoolgaande kinderen (5-17 jaar) in Schotland keerde terug naar school.5 Dergelijke trends op nationaal niveau (en meer lokale) zijn sterk afhankelijk van de context, waaronder de lokale prevalentie en dynamiek van overdracht van de deltavariant, terugkeer naar school, veranderingen in sociale mengpatronen, thuis- versus kantoorwerk en niveaus van vaccin-geïnduceerde en natuurlijk verworven immuniteit.

Hier beschrijven we de onderliggende dynamische patronen in de prevalentie van SARS-CoV-2 in september 2021 in Engeland door de positiviteit van RT-PCR-swab te analyseren uit de veertiende ronde van gegevensverzameling van de real-time Assessment of Community Transmission{{ 5}} (REACT-1) onderzoek.6,7 In deze ronde werden keel- en neusuitstrijkjes verkregen uit een willekeurige steekproef van de bevolking van Engeland van 9 tot 27 september 2021. We combineerden ook gegevens van ronde 14 met gegevens van ronde 13, waarin van 24 juni tot 12 juli 2021 swabs zijn afgenomen.

cistanche extract poeder

Methoden:

Studiepopulatie

De onderzoeksmethoden van REACT-1 zijn elders gerapporteerd.7 Kort: met het verzamelen van gegevens vanaf 1 mei 2020, hebben we willekeurige steekproeven van de bevolking in Engeland (leeftijd groter dan of gelijk aan 5 jaar) uitgenodigd voor het onderzoek. ). De gegevens werden maandelijks verzameld over een periode van 2-3 weken, behalve in december 2020 en augustus 2021, toen er geen enquête werd gehouden. Bij elke ronde van gegevensverzameling werden benoemde personen uit de NHS-lijst van patiënten die bij een huisarts in Engeland waren geregistreerd, uitgenodigd om deel te nemen aan het onderzoek, op basis van lijsten verkregen van NHS Digital.

Van 1 mei 2020 (start van ronde 1) tot 3 mei 2021 (einde van ronde 11) streefden we naar ongeveer gelijke aantallen deelnemers in elk van de 315 lagere lokale overheden in Engeland (samen de Isles of Scilly met Cornwall en de City of London met Westminster), maar vanaf ronde 12 (20 mei tot 7 juni 2021) hebben we de steekproefprocedure aangepast om een ​​aselecte steekproef te verkrijgen in verhouding tot de populatie op het lagere gemeentelijk niveau. Dit verhoogde de steekproef in binnenstedelijke gebieden met een hogere bevolkingsdichtheid, hoewel de prevalentierapportage niet werd beïnvloed omdat we de gegevens bij elke ronde hebben gewogen om representatief te zijn voor Engeland als geheel (hieronder beschreven).

RT-PCR-test- en vaccinatiegegevens

Deelnemers verstrekten een zelf toegediend keel- en neusuitstrijkje (of een ouder of voogd kreeg een uitstrijkje voor kinderen van 5-12 jaar) volgens schriftelijke en video-instructies. Wattenstaafjes werden naar een centraal laboratorium gestuurd voor analyse met RT-PCR. Geëxtraheerd nucleïnezuur werd geanalyseerd op de aanwezigheid of afwezigheid van SARS-CoV-2 met de ViroBOAR 1·0 RT-qPCR-kit (Eurofins Genomics, GmbH, Ebersberg, Duitsland) voor SARS-CoV{{10 }} op de Roche Lightcycler 480 II om parallel twee gendoelen te detecteren: het N-gen en het E-gen. De test heeft een specificiteit van bijna 100 procent en een detectielimiet van tien kopieën per microliter. Monsters werden als positief beschouwd als de twee gendoelen (het N-gen en het E-gen) werden gedetecteerd of als het N-gen werd gedetecteerd met een cyclusdrempelwaarde (Ct) van minder dan 37.

Voor ronde 14 hebben we de manier aangepast waarop de uitstrijkjes werden behandeld. Van ronde 1 (vanaf 1 mei 2020) tot ronde 13 (eindigend op 12 juli 2021) hebben we droge swabs gebruikt die per koerier gekoeld naar het laboratorium werden gestuurd voor RT-PCR-testen. In ronde 14 schakelden we over op natte wattenstaafjes in zoutoplossing, die vervolgens willekeurig werden toegewezen op een 1:1-basis om ofwel per koerier te worden verzonden (n=46 705 geldige wattenstaafjes terug) of per post (n{{12} }).

Als onderdeel van het REACT-1-onderzoek hebben we gegevens over leeftijd, geslacht, adres en woonplaats-postcode verkregen uit het NHS-register, met meer informatie over demografie, gezondheid (inclusief zelfgerapporteerde vaccinatiestatus) en levensstijl afgeleid van een online of telefonische vragenlijst. Deelnemers werd om toestemming gevraagd voor koppeling aan hun NHS-gegevens, inclusief gegevens van het COVID-19-vaccinatieprogramma. Vaccinatiestatus uit gegevenskoppeling werd afgeleid met de veronderstelling dat één dosis pas effectief zou zijn vanaf 14 dagen of meer na injectie. Niet-gevaccineerde mensen werden daarom gedefinieerd als degenen die geen vaccindosis hadden gekregen of minder dan 14 dagen vóór het afnemen van een vaccin; Gevaccineerde mensen met een enkelvoudige dosis werden gedefinieerd als degenen die 14 dagen of meer vóór het afnemen van een uitstrijkje één dosis kregen en ofwel geen tweede dosis of een tweede dosis minder dan 14 dagen vóór het afnemen, en mensen die twee vaccindoses hadden gekregen, werden gedefinieerd als degenen die een hun tweede dosis 14 dagen of langer vóór het afnemen.

Virale genoomsequencing

Na RT-PCR-testen werden positieve monsters met N-gen-Ct-waarden van minder dan 34 en met voldoende materiaal ingevroren en opgestuurd voor virale genoomsequencing bij het Quadram Institute, Norwich, VK. Het ARTIC SARS-CoV-2 sequencingprotocol8 werd gebruikt voor de amplificatie van viraal RNA en het CoronaHiT-platform werd gebruikt voor de voorbereiding van sequencingbibliotheken.9 De ARTIC bioinformatic-pijplijn10 werd gebruikt voor de analyse van sequencinggegevens en er werden afstammelingen toegewezen met PangoLEARN.11

statistische analyse

Statistische analyses zijn uitgevoerd in R-software (R-versie 4.0.5 (31/03/2021, Shake and Throw). We hebben de ongewogen SARS-CoV-2-prevalentie berekend op sociodemografische, beroepsmatige en andere groepen door het aantal swab-positiviteit (van RT-PCR) te delen door het aantal geldige swabs dat is geretourneerd.We gebruikten rim weighting12 om de prevalentie te verkrijgen die representatief was voor de bevolking van Engeland als geheel.

We gebruikten een exponentieel model van groei of verval om trends in swab-positiviteit in de loop van de tijd te analyseren. We gingen ervan uit dat het aantal positieve monsters (uit het totaal aantal monsters) per dag voortkwam uit een binominale verdeling op basis van de dag van de uitstrijk of, indien niet beschikbaar, de dag van monsterafname (koerier) of eerste scan van het monster door de Postkantoor, indien per post verzonden. We hebben posterieure geloofwaardige intervallen (CrI's) geschat met behulp van een bivariate No-U-Turn Sampler, uitgaande van uniforme eerdere distributies van de kans op positiviteit van het uitstrijkje op dag nul en de groeisnelheid.13 We schatten het reproductiegetal (R) ervan uitgaande dat de generatietijd gamma-gedistribueerd was met vormparameter n=2·29 en snelheidsparameter =0·36 (overeenkomend met een gemiddelde generatietijd van 6·29 dagen).14

We passen een Bayesiaans penalized-spline (P-spline) -model16 aan de dagelijkse gegevens met behulp van gegevens van alle REACT-ronden-1. Voor het schatten van de dagelijkse prevalentie van swab-positiviteit werd gebruik gemaakt van een No-U-Turn Sampler in logit-ruimte, waarbij de gegevens werden gesegmenteerd in ongeveer 5-dagsecties door regelmatig gespreide knopen (waardoor een passend evenwicht wordt verkregen tussen tijdsresolutie en computationele haalbaarheid), en verdere knopen opgenomen buiten de onderzoeksperiode om randeffecten te minimaliseren. We passen ook P-splines aan op de REACT-1-gegevens gestratificeerd naar leeftijd zoals hierboven, waarbij een P-spline afzonderlijk werd aangepast aan elke leeftijdsgroep, maar de afvlakkingsparameter, ρ, werd verondersteld de best passende waarde te zijn die werd verkregen voor het model dat bij alle gegevens past. Voor de duidelijkheid, hoewel de schattingen zijn gebaseerd op de volledige REACT-1-dataset, rapporteren we hier alleen schattingen voor ophaaldagen van ronde 14.

We hebben de vaccineffectiviteit tegen SARS-CoV-2-infectie geschat door gegevens uit ronde 13 en 14 te combineren om de statistische power te vergroten. We schatten de vaccineffectiviteit als 1-odds ratio (OR), waarbij de OR werd verkregen uit een logistisch regressiemodel van het risico op swab-positiviteit bij dubbel gevaccineerden (dwz degenen met twee doses, waarbij de tweede dosis meer dan 14 dagen werd toegediend voor het afnemen van een uitstrijkje) en niet-gevaccineerde personen, met correctie voor ronde, vervolgens aanvullend voor leeftijd en geslacht, en verdere correctie voor een index van meervoudig deprivatiekwintiel en etniciteit. We hebben de ethische goedkeuring voor onderzoek verkregen van de South Central-Berkshire B Research Ethics Committee (Integrated Research Application System [IRAS] ID: 283787).

voordelen van cistanche-extract

Resultaten

Van 822176 personen die waren uitgenodigd om deel te nemen aan ronde 14, hebben 147393 (17,9 procent) zich geregistreerd en 100527 (12,2 procent) verstrekten een uitstrijkje met een geldig RT-PCR-resultaat, waarbij 87966 (87,5 procent) instemden met gegevenskoppeling . In ronde 13 werden 841227 deelnemers uitgenodigd; 147332 geregistreerd en 98233 (66,7 procent) van hen verstrekten een uitstrijkje met een geldig RT-PCR-resultaat. Het bundelen van gekoppelde gegevens van beide ronden resulteerde in 172862 deelnemers, waaronder 102142 (49923 in ronde 13 en 52219 in ronde 14) in de leeftijd van 18-64 jaar die werden opgenomen in onze vaccineffectiviteitsanalyses (bijlage p 7). Een beschrijving van de kenmerken van de REACT-1-deelnemers uit ronde 13 en ronde 14 toonde aan dat degenen die instemden met datakoppeling, eerder mannen waren van 45 jaar of ouder, niet woonachtig in Londen, White, uit een alleenstaande huishouden, en COVID-19-gerelateerde symptomen te hebben ervaren. De meeste van deze verschillen waren relatief klein (bijlage p 2). De prevalentie was iets hoger en de Ct-waarden voor positieve monsters waren iets lager in swabs die per koerier werden verzameld dan in swabs die per post werden verzonden (bijlage pp 3, 8).

Van de 100527 geldige uitstrijkjes in ronde 14 waren er 764 positief, wat een prevalentie van 0·83 procent geeft (95 procent CrI 0·76–{{ 57}}·89) gewogen om representatief te zijn voor de bevolking van Engeland (bijlage p 4). De hoogste gewogen prevalentie op 2 september021 werd waargenomen bij tieners van 13-17 jaar, 2,55 procent (95 procent CrI 2,11-3·08) en bij kinderen in de leeftijd van 5-12 jaar, met 2,32 procent (1,96-2,73; tabel 1, bijlage p 9). De P-spline voor ronde 14, passend bij de gegevens van alle REACT-1-rondes, was indicatief voor een stabiele of toenemende trend in de prevalentie van swab-positiviteit (figuur 1A), met R geschat op 1·{{68} }3 (95 procent CrI 0·94–1.14) voor alle leeftijden samen (tabel 2). De aangepaste P-splines duidden op een toenemende prevalentie op de leeftijd van 5-11 jaar en een afnemende prevalentie op de leeftijd van 18-54 jaar (figuur 1B), met een posterieure kans van meer dan 99 procent dat de groeisnelheid verschilde tussen deze twee groepen. De corresponderende R was 1,42 (95 procent CrI 1,18–1,68), met een grotere dan 0·99 posterieure kans dat R groter was dan 1 op de leeftijd van 5-11 jaar; R was 0·95 (0·76–1·16), met een posterieure kans van 0,32 dat R groter was dan 1 bij personen van 12–17 jaar; en R was 0,81 (0,68-0,97), met een posterieure kans van 0,01 dat R groter was dan 1 bij personen van 18-54 jaar (tabel 2).

Weighted prevalence also varied by region (table 1; appendix p 9), ranging from 0·57% (95% CrI 0·45–0·72) in the South East to 1·25% (1·00–1·57) in Yorkshire and The Humber. Within round 14, there was evidence of epidemic growth (with a posterior probability greater than 0·99 that R>1) in Londen, met een R van 1,59 (95 procent CrI 1,23-1,99), en in de East Midlands, met een R van 1,36 (1,05-1,73; tabel 2) .

We vonden een hogere gewogen prevalentie van swab-positiviteit bij deelnemers van zwarte etniciteit, op 1,41 procent (95 procent CrI 0·91-2·19), vergeleken met die van blanke deelnemers, op 0 ·78 procent (0·72–0·85; tabel 1). Deelnemers in grotere huishoudens hadden een hogere gewogen prevalentie dan die in kleinere huishoudens, variërend van 0·33 procent (95 procent CrI 0·25–0·44) voor eenpersoonshuishoudens huishoudens tot 1,75 procent (1,24-2,46) voor huishoudens met zes of meer personen (tabel 1). De prevalentie was ook hoger in huishoudens met een of meer kinderen, namelijk 1,37 procent (95 procent CrI 1,22-1,52) vergeleken met 0·40 procent ({{4{ {49}}}}·35–0·46) voor huishoudens zonder kinderen; en gewogen prevalentie was 7,35 procent (6,5{0–8,31) onder degenen die aangaven in contact te zijn geweest met een bevestigd geval van COVID-19, vergeleken met 0,43 procent (0,38 –0,49) onder degenen die geen dergelijk contact hebben (tabel 1).

Met behulp van zelfgerapporteerde vaccinatiestatus vonden we een hogere prevalentie bij niet-gevaccineerde deelnemers (alle leeftijden), bij 1,73 procent (95 procent CrI 1,42-2,12), vergeleken met degenen die twee vaccindoses rapporteerden, bij {{8 }}·56 procent ({{10}}·50–0.62; tabel 1).

In multivariabele logistische regressieanalyse hadden andere belangrijke werknemers dan gezondheidswerkers en verpleeghuiswerkers een verhoogd risico op swabpositiviteit vergeleken met andere werknemers (OR 1,35 [95 procent BI 1,10–1·66]; tabel 3) . De positiviteit van de uitstrijkjes was ook hoger naarmate de grootte van het huishouden groter werd (wederzijds gecorrigeerde OR 1,77 [95 procent BI 1,44-2,17] voor huishoudens van drie tot vijf personen en 2,37 [1,62-3,47] voor huishoudens van zes of meer personen), vergeleken met huishoudens met één of twee personen.

We hebben de gekoppelde vaccingegevens van ronde 13 en 14 samengevoegd (172862 deelnemers in totaal, 19325 in de leeftijd)<18 years,="" 102142="" aged="" 18–64="" years,="" and="" 51395="" aged="" ≥65="" years).="" because="" of="" the="" relatively="" small="" numbers="" of="" individuals="" vaccinated="" below="" the="" age="" of="" 18="" years,="" corresponding="" participants="" (n="19325)" were="" excluded="" from="" our="" vaccine="" effectiveness="" analyses.="" weighted="" prevalence="" was="" higher="" for="" those="" who="" received="" their="" second="" dose="" 3–6="" months="" before="" their="" swab="" than="" for="" those="" whose="" second="" dose="" was="" up="" to="" 3="" months="" before="" their="" swab="" (0·55%="" [95%="" cri="" 0·50–0·61]="" vs="" 0·35%="" [0·31–0·40];="" figure="" 2a;="" appendix="" p="" 5).="" the="" weighted="" prevalence="" for="" individuals="" whose="" second="" dose="" was="" administered="" more="" than="" 6="" months="" before="" their="" swab="" was="" similar="" to="" that="" of="" those="" vaccinated="" within="" 3–6="" months="" of="" their="" swab,="" at="" 0·52%="" (95%="" cri="" 0·33–0·78),="" but="" with="" a="" wider="" credible="" interval.="" the="" age="" distribution="" of="" participants="" by="" vaccination="" status="" indicated,="" as="" expected="" from="" the="" age-based="" rollout="" of="" the="" vaccine="" program="" in="" england,="" a="" higher="" proportion="" of="" individuals="" aged="" 35="" years="" and="" older="" among="" those="" who="" had="" received="" two="" vaccine="" doses="" compared="" to="" those="" who="" had="" received="" a="" single="" dose,="" or="" those="" who="" were="" unvaccinated="" (appendix="" p="" 5).="" nevertheless,="" among="" those="" who="" had="" received="" two="" vaccine="" doses,="" we="" observed="" similar="" age="" distributions="" in="" people="" who="" had="" received="" their="" second="" dose="" 3–6="" months="" or="" more="" than="" 6="" months="" before="" swabbing.="" regardless,="" in="" individuals="" aged="" 18="" years="" and="" older="" with="" linked="" data="" on="" vaccination="" status,="" the="" weighted="" prevalence="" in="" unvaccinated="" people,="" at="" 1·76%="" (95%="" cri="" 1·60–1·95),="" was="" three="" to="" five="" times="" higher="" than="" in="" double-vaccinated="" individuals,="" at="" 0·47%="" (0·43–0·51).="" reflecting="" the="" rollout="" of="" the="" vaccine="" program="" in="" england,="" a="" higher="" proportion="" of="" individuals="" who="" were="" unvaccinated="" or="" who="" had="" a="" single="" dose="" of="" the="" vaccine="" were="" younger="" (≤54="" years)="" than="" those="" with="" two="" doses="" (figure="" 2b;="" appendix="" p="" 5).="" however,="" in="" double-vaccinated="" participants,="" there="" was="" an="" apparent="" trend="" of="" increasing="" weighted="" prevalence="" in="" each="" age="" group="" for="" those="" who="" had="" received="" their="" second="" dose="" 3–6="" months="" before="" their="" swab="" compared="" to="" those="" who="" were="" vaccinated="" up="" to="" 3="" months="" before="" (figure="">

Schattingen van de werkzaamheid van het vaccin werden afgeleid met de gekoppelde dataset voor ronde 13 en 14 gecombineerd voor alleen personen van 18-64 jaar, aangezien weinig mensen ouder dan 65 jaar niet waren gevaccineerd (1,1 procent) en, zoals opgemerkt, weinig mensen jonger dan 18 jaar jaar werden gevaccineerd (6,3 procent in ronde 13 en 14 gecombineerd). Voor alle personen van 18-64 jaar en alle vaccins samen was de werkzaamheid van het vaccin tegen infectie 66,3 procent (95 procent BI 55,3-74,7), met correctie voor ronde, en 62,8 procent (49,3– 72·7) in het volledig aangepaste model. Volledig aangepaste schattingen van de effectiviteit van het vaccin voor de BNT162b2- (Pfizer-BioNTech) en mRNA-1273 (Moderna)-vaccins waren vergelijkbaar (71,3 procent versus 75,1 procent, met een veel breder betrouwbaarheidsinterval voor het mRNA{{34). }} [Moderna]-vaccin vanwege een kleiner aantal waarnemingen) en hoger dan geschat voor het ChAdOx1 nCov-19 (Oxford-AstraZeneca)-vaccin (44,8 procent). Verschillen in schattingen van de vaccineffectiviteit per vaccintype bereikten echter geen statistische significantie op een 0·05 significantieniveau. De opname van een interactieterm voor vaccin per ronde suggereerde niet dat effecten werden gewijzigd in ronde 13 en 14 (gegevens niet getoond). De schattingen van de werkzaamheid van het vaccin in modellen die beperkt waren tot symptomatische gevallen waren vergelijkbaar met die van modellen die ook asymptomatische gevallen bevatten (tabel 4).

Afstammelingen van de 475 (62,2 procent) monsters die werden gesequenced onder de 764 positieve uitstrijkjes waren alle deltavarianten of sublijnen van de delta. AY.4 was de meest gedetecteerde sublijn en vertegenwoordigde 61,5 procent (95 procent CI 57·0–65·7) van de monsters waarvan de sequentie werd bepaald, en er waren zeven monsters met interessante mutaties met enkele piek, zoals gedefinieerd door Public Health England (nu de UK Health Security Agency): Glu484Lys, Asn501Tyr, Phe490Ser, Arg246Gly, Val483Phe, Pro251Leu en Gln613His (bijlage p 6). We identificeerden 22 monsters (acht met de B.1.617.2-lijn en 14 de AY.4-lijn) inclusief de Tyr145His-mutatie in het spike-eiwit, geassocieerd met de AY.4.2 delta-sublijn, overeenkomend met 4,63 procent (95 procent CI 3·07–6·91) van alle geslachten bepaald.

verbeteren immuniteit cistanche capsules

Discussie

In deze veertiende ronde van het REACT-1-onderzoek vonden we in september 2021 zowel een hoge als toenemende prevalentie van SARS-CoV-2-uitstrijkjes bij schoolgaande kinderen in Engeland, wat een weerspiegeling is van de toegenomen sociale vermenging van kinderen als ze gingen naar school voor de herfstperiode. Tegelijkertijd vonden we een afnemende prevalentie onder jongeren van middelbare leeftijd tot volwassenen (18-54 jaar). Deze observatie kan een weerspiegeling zijn van het effect van eerdere natuurlijke infectie, vooral onder jongere volwassenen bij wie het infectiepercentage hoog was,17 en de voortzetting van de uitrol van het vaccinatieprogramma in Engeland. Vanaf april 2021 is het nationale vaccinatieprogramma tegen COVID-19 uitgebreid met volwassenen jonger dan 50 jaar18, vanaf augustus 2021 een eenmalige vaccindosis voor oudere tieners (16-17 jaar) en een enkele dosis voor kinderen van 12-15 jaar vanaf half september 2021.

Vanaf medio tot eind december 2021 krijgen alle kinderen van 12 jaar en ouder een tweede vaccindosis aangeboden en wordt een derde (booster)dosis uitgerold naar de volwassen bevolking van 18 jaar en ouder. Net als in ons vorige rapport19 (ronde 13), ontdekten we dat alle gesequenced swabs van de delta-variant en zijn sublijnen waren, wat op dat moment in Engeland op dat moment bijna volledige vervanging van alfa en andere varianten door delta in Engeland aangeeft. We hebben één potentiële ontsnapping Glu484Lys-mutatie gedetecteerd, wat zich vertaalt in naar schatting 984 van dergelijke infecties in Engeland met een lagere betrouwbaarheidslimiet van 95 procent van 159. In totaal waren er zeven monsters met interessante mutaties met enkele piek, zoals gedefinieerd door Public Health England. Nog eens 22 monsters omvatten de Tyr145His-mutatie in het spike-eiwit dat is geassocieerd met de AY.4.2-sublijn.

Het overeenkomstige AY.4-aandeel van 4,63 procent (95 procent CI 3,07–6,91) over alle geslachten is in lijn met de 6 procent van de gevallen die zijn gemeld door Public Health England in de week die begint op 27 september 2021.20 bleek zeer effectief tegen ernstige complicaties van COVID-19, waaronder ziekenhuisopnames en overlijden, maar er is minder duidelijkheid over bescherming tegen infectie. Hoewel schattingen van de vaccineffectiviteit tegen infectie tot 90 procent zijn gerapporteerd, gebaseerd op routinetests van symptomatische individuen, rapporteren we hier een schatting van de vaccineffectiviteit tegen infectie van 63 procent uit REACT-1 rondes 13 en 14, toen de deltavariant domineerde.

Deze bevinding is vergelijkbaar met wat werd gerapporteerd in de gekoppelde gegevens voor alleen ronde 13,19 maar door gegevens van beide rondes 13 en 14 te combineren, konden we ook de vaccineffectiviteit schatten voor de ChAdOx1 nCov-19 (Oxford-AstraZeneca) en BNT162b2 (Pfizer-BioNTech) vaccins afzonderlijk. Hoewel de betrouwbaarheidsintervallen elkaar overlappen, suggereren onze resultaten een hogere effectiviteit tegen infectie met het BNT162b2 (Pfizer-BioNTech) vaccin dan met het ChAdOx1 nCov-19 (Oxford-AstraZeneca) vaccin. Grotere verschillen tussen vaccins werden gemeld in een eerdere studie22 en door Public Health England (nu UK Health Security Agency [UK HSA]) op basis van routinetests van symptomatische gevallen.23 Niettemin moet worden opgemerkt dat de effectiviteit van vaccins specifiek is voor de populatie en tijd, dus deze schattingen weerspiegelen de prestaties van de vaccins in Engeland gedurende een specifieke periode (dwz juni-september 2021). Sindsdien was de omicron-variant (B.1.1.529) in december 2021 dominant geworden in Engeland, waarbij studies van de Britse HSA wezen op een lagere vaccineffectiviteit tegen symptomatische infectie voor omicron in vergelijking met de delta.24

Onze studie toont aan dat de prevalentie van swab-positiviteit bij niet-gevaccineerde personen (inclusief alle kinderen van 5-11 jaar) of personen die één vaccindosis kregen (inclusief kinderen van 12-17 jaar) drie tot vier keer hoger was dan bij dubbel gevaccineerde personen , maar suggereert ook dat de prevalentie van swab-positiviteit die wijst op doorbraakinfecties na vaccinatie met twee doses na 3-6 maanden zou kunnen toenemen. Bovendien ontdekten we dat mensen die in grotere huishoudens wonen en mensen die in huishoudens met kinderen wonen, een hogere swab-positiviteit hadden dan mensen in kleinere huishoudens of mensen zonder kinderen in het huishouden. De bevinding van de hoogste gewogen prevalentieniveaus in swab-positiviteit tijdens ronde 14 bij kinderen van 5-11 jaar en 12-17 jaar roept bezorgdheid op voor klinisch extreem kwetsbare kinderen en klinisch extreem kwetsbare nauwe contacten, waaronder leden van het huishouden en schoolpersoneel.

Vanaf eind december 2021 krijgen klinisch kwetsbare kinderen van 5-11 jaar twee doses vaccin aangeboden. Er zijn ook zorgen over de effecten op het onderwijs voor de grote aantallen kinderen die niet naar school gaan als ze positief testen als gevolg van het hoge percentage SARS-CoV-2-infecties. De bevinding dat de prevalentie meer dan drie keer groter was bij personen in huishoudens met een of meer kinderen dan bij personen in huishoudens zonder kinderen, suggereert dat infecties bij kinderen zich, niet verwonderlijk, verspreiden naar andere leeftijdsgroepen. Hogere virale lasten geassocieerd met de delta-variant bij jongere personen in vergelijking met eerdere varianten 25-27 kunnen ook de transmissie-efficiëntie van kinderen verhogen en daarom bijdragen aan hogere infecties binnen het huishouden. Op 27 september 2021 waren slechts 1214 (6,3 procent) kinderen van 12–17 jaar gevaccineerd in de REACT-1-studie, waardoor een zinvolle uitbreiding van onze vaccineffectiviteitsanalyses naar die leeftijdsgroep in ronde 14.

Verdere studies naar de werkzaamheid van vaccins zijn nodig gezien de snelle toename van ommicron-infecties in Engeland vanaf december 2021, en de introductie van vaccinaties met dubbele dosis voor schoolkinderen van 12-15 jaar, boosterdoses in de leeftijd van 16-17 jaar en bij volwassenen van 18 jaar en ouder. Daarnaast maken community-based studies zoals REACT-1 het mogelijk om de effectiviteit van het vaccin tegen infectie te schatten bij mensen met zowel asymptomatische als symptomatische infecties. Hoewel er na de vaccinatiecampagne een relatieve ontkoppeling is geweest tussen SARS-CoV-2-infecties en ziekenhuisopnames en sterfgevallen in Engeland, blijft er bezorgdheid bestaan ​​over de mogelijkheid dat hoge infectiepercentages en onvolledige bevolkingsimmuniteit resulteren in een verhoogd risico op ernstige complicaties door COVID-19. Engeland begon, net als de rest van het VK en verschillende andere landen (met name Israël28), een campagne om vanaf oktober 2021 in Engeland derde (booster) doses uit te rollen. Aanvankelijk ging het om prioritering van volwassenen van 50 jaar en ouder, gezondheids- en maatschappelijk werkers en risicojongeren, maar de uitrol werd vervolgens vanaf eind december 2021 uitgebreid naar alle volwassenen van 18 jaar en ouder.29 Doorlopende monitoring van de epidemie in Engeland en elders zal belangrijk zijn om te peilen in hoeverre boosterdoses bij volwassenen en vaccinatie bij kinderen de overdracht van nieuwe SARS-CoV-2-varianten, zoals de omicron-variant, inperken.

Onze studie heeft beperkingen. Sinds het REACT-1-onderzoek in mei 2020 begon met het verzamelen van gegevens, zagen we een geleidelijke afname van de responspercentages, van 30,5 procent in ronde 1 tot 11,7 procent in ronde 13. In ronde 14 was de respons echter tarief licht gestegen tot 12,2 procent. Deze stijging, zij het klein, is bemoedigend. Het kan zijn dat verdere wijzigingen in het onderzoek de deelname verder kunnen vergroten. De verandering naar het gebruik van natte swabs in zoutoplossing en het verzamelen van monsters zonder de koudeketen (per post of koerier) kan de diagnostische gevoeligheid hebben beïnvloed. We waren gerustgesteld door de beperkte verschillen tussen de monsters die per post en koerier werden verzameld.

Omdat het exacte systeem dat in eerdere rondes werd gebruikt (droge swabs en een aanhoudende koudeketen) echter niet binnen de buurt werd vergeleken, konden we de impact van de nieuwe aanpak niet inschatten in vergelijking met die in eerdere rondes. Een verdere beperking is dat we niet over nauwkeurige gegevens beschikken over de vaccinatiestatus van alle deelnemers. Hoewel de toestemming voor het koppelen van gegevens op een hoog niveau was (87,5 procent in ronde 14), stemden niet alle deelnemers ermee in om te koppelen aan hun NHS-gegevens, waaronder gegevens van het COVID-19-vaccinatieprogramma. Voor degenen van wie de gegevens niet zijn gekoppeld, ontbreken gegevens over de data van vaccinatie en vaccintype of zijn ze minder betrouwbaar dan in de gekoppelde gegevens; daarom hebben we onze schattingen van de effectiviteit van vaccins gebaseerd op de subset van deelnemers met gekoppelde records. Deze benadering heeft mogelijk een vooroordeel geïntroduceerd in de mate dat degenen die wel en niet instemmen met gegevenskoppeling, op belangrijke manieren kunnen verschillen, zoals sociale mengpatronen, die het risico op infectie kunnen beïnvloeden.

Bovendien, voor onze schattingen van de vaccineffectiviteit per vaccintype, hoewel we in onze steekproef voor leeftijd en ronding controleerden, zou de amplitude van de verschillen tussen vaccins overdreven kunnen zijn. Dit komt omdat er verschillende leeftijdsspecifieke patronen waren bij de toediening van vaccins (waarbij het ChAdOx1 n Cov-19 [Oxford-AstraZeneca]-vaccin voornamelijk werd toegediend aan mensen van 40 jaar of ouder), evenals verschillen in transmissiedynamiek voor de leeftijdsgroepen die de verschillende vaccins hebben ontvangen. REACT-1 was niet in het veld in augustus 2021, dus er was een vertraging van bijna 2 maanden tussen het einde van ronde 13 op 12 juli en het begin van ronde 14 op 9 september 2021.

Hoewel het mogelijk is dat de schattingen van de vaccineffectiviteit in deze periode kunnen variëren, hebben we geen bewijs gevonden voor een interactie tussen ronde- en vaccineffecten. Concluderend vonden we bewijs van de toenemende prevalentie van swab-positiviteit bij schoolgaande kinderen, evenals een hogere prevalentie van swab-positiviteit 3-6 maanden na vaccinatie met twee doses tegen COVID-19 bij volwassenen. Voortdurende inspanningen om schoolgaande kinderen te vaccineren en een boosterdosis toe te dienen aan alle volwassenen van 18 jaar en ouder zouden moeten helpen om elke vermindering van de immuniteit op zowel individueel als populatieniveau tegen te gaan. In het winterseizoen in Engeland wordt de NHS doorgaans onder druk gezet door griep en andere virussen, en dit is in december 2021 verergerd door de snelle toename van omicron-infecties. Het is daarom belangrijk dat het vaccinatieprogramma een hoge dekkingsgraad behoudt, inclusief boosters, en een hoog percentage kinderen en niet-gevaccineerde of gedeeltelijk gevaccineerde volwassenen bereikt om de overdracht van SARS-CoV-2 en de daarmee samenhangende verstoringen van werk en onderwijs te verminderen.

cistanche tubolosa-supplement: verbeter de immuniteit

Referenties

1 Paritair Comité voor Vaccinatie en Vaccinatie. Advies over prioriteitsgroepen voor vaccinatie tegen COVID-19, 30 december 2020.

2 Riley S, Wang H, Eales O, et al. REACT-1 ronde 12-rapporten: de heropleving van SARS-CoV-2-infecties in Engeland geassocieerd met verhoogde frequentie van de Delta-variant. medRxiv 2021; online gepubliceerd op 21 juni.

3 NHS Engeland. COVID-19-vaccinaties.

4 Britse ministerie van Onderwijs. Toelichting: acties voor scholen tijdens de uitbraak van het coronavirus. 2 juli 2020.

5 BBC-nieuws. Eerste Schotse leerlingen terug naar school voor een nieuw semester voorbij niveau nul. BBC.

6 Riley S, Ainslie KEC, Eales O, et al. Heropleving van SARS-CoV-2: detectie door virale surveillance door de gemeenschap. Wetenschap 2021; 372: 990-95.

7 Riley S, Atchison C, Ashby D, et al. Realtime beoordeling van gemeenschapsoverdracht (REACT) van het SARS-CoV-2-virus: onderzoeksprotocol. Welkom Open Res 2020; 5: 200.

8 Quick J. nCoV-2019 sequencing-protocol v3 (Locost). 2020; online gepubliceerd op 25 augustus. https://www.protocols.io/view/ncov-2019- sequencing-protocol-v3-Locost-bh42j8ye (toegankelijk op 4 mei 2021).

9 Baker DJ, Aydin A, Le-Viet T, et al. CoronaHiT: high-throughput-sequencing van SARS-CoV-2-genomen. Genoom Med 2021; 13: 21.

10 [Geen auteurs vermeld]. Een Nextflow-pijplijn voor het uitvoeren van de bioinformatica-tools van het ARTIC-netwerk. Github.

11 [Geen auteurs vermeld]. Fylogenetische toewijzing van benoemde wereldwijde uitbraaklijnen (PANGOLIN). Github.

12 Sharot T. Weging onderzoeksresultaten. J Mark Res Soc 1986; 23: 269-84. 13 Hoffman MD, Gelman A. De no-U-turn sampler: adaptief instellen van padlengtes in Hamiltonian Monte Carlo. J Mach Leer Onderzoek 2014; 15: 1533-623.

14 Bi Q, Wu Y, Mei S, et al. Epidemiologie en overdracht van COVID-19 in 391 gevallen en 1286 van hun nauwe contacten in Shenzhen, China: een retrospectieve cohortstudie. Lancet Infect Dis 2020; 20: 911-19.

15 Wallinga J, Lipsitch M. Hoe generatie-intervallen de relatie tussen groeisnelheden en reproductieve aantallen vormen. Proc Biol Sci 2006; 274: 599-604.

16 Lang S, Brezger A. Bayesiaanse P-splines. J Berekening Grafiek Stat 2004; 13: 183-212.

17 Bureau voor Nationale Statistiek. Laatste inzichten coronavirus (COVID-19): infecties. 7 januari 2022.

18 Britse ministerie van Volksgezondheid en Sociale Zorg. Persbericht: het VK gaat de volgende fase van de uitrol van vaccins in, aangezien het overheidsdoel vroeg werd bereikt. 13 april 2021.

19 Elliott P, Haw D, Wang H, et al. Exponentiële groei, hoge prevalentie van SARS-CoV-2 en vaccineffectiviteit geassocieerd met de Delta-variant. Wetenschap 2021; 374: ebl9551.

20 UK Health Security Agency. SARS-CoV-2 varianten van zorg en varianten in onderzoek in Engeland. Technische briefing 25. 15 okt 2021.

21 Lopez Bernal J, Andrews N, Gower C, et al. Effectiviteit van Covid-19-vaccins tegen de B.1.617.2 (Delta) variant. N Engl J Med 2021; 385: 585-94.

22 Pouwels KB, Pritchard E, Matthews PC, et al. Effect van Delta-variant op de virale last en vaccineffectiviteit tegen nieuwe SARS-CoV-2-infecties in het VK. Nat Med 2021; online gepubliceerd

23 Volksgezondheid Engeland. COVID-19-vaccinbewakingsrapporten (week 19 tot 38). 14 mei 2021.

24 UK Health Security Agency. SARS-CoV-2 varianten van zorg en varianten in onderzoek in Engeland. Technische briefing: update over ziekenhuisopname en vaccineffectiviteit voor Omicron VOC-

25 Jones TC, Biele G, Mühlemann B, et al. Schatting van de besmettelijkheid tijdens het SARS-CoV-2 infectieverloop. Wetenschap 2021; 373: eabi5273.

26 Bellon M, Baggio S, Jacquerioz Bausch F, et al. Ernstig acuut respiratoir syndroom coronavirus 2 (SARS-CoV-2) virale belastingkinetiek bij symptomatische kinderen, adolescenten en volwassenen. Clin Infect Dis 2021; 73: e1384-86.

27 Li B, Deng A, Li K, et al. Virale infectie en overdracht in een grote, goed opgespoorde uitbraak veroorzaakt door de SARS-CoV-2 Delta-variant. MedRxiv 2021; online gepubliceerd op 23 juli.

28 Bar-On YM, Goldberg Y, Mandel M, et al. Bescherming van BNT162b2-vaccinbooster tegen Covid-19 in Israël. N Engl J Med 2021; 385: 1393–400.

29 UK Health Security Agency. COVID-19-vaccinatie: een gids voor boostervaccinatie voor personen van 40 jaar en ouder.